胡乔木在会议上发言指出：1957年以后，搞一次运动，生产就被破坏一次。为什么？根本原因在于生产力没有变化，却要不断改变生产关系。
胡乔木的发言，带着特定的时代色彩。但是这样的思索在当时也是属于超前的。会后，简报组很快将他的发言整理稿送来，请他过目。会议简报全文刊登了胡的发言，引起了热烈的反响。
在与会者的强烈要求下，中央政治局常委会作出了几项平反冤假错案、解决历史遗留问题的决定。14日，北京市委作出决定，宣布天安门事件是革命行动。当天，中央政治局常委会批准了北京市委的决定。
11月25日，召开全体会议，华国锋代表政治局宣布了9条决定：
一、中央认为天安门事件完全是革命的群众运动，并予以公开平反；二、“反击右倾翻案风”是错误的，涉此有关文件全部销毁，责任由中央承担；三、因所谓“二月逆流”一案受冤屈的所有人，一律恢复名誉，受过牵连和处分的，一律平反；四、为薄一波等61人问题的重要案件予以平反；五、过去怀疑彭德怀里通外国是没有根据的，应予否定，其骨灰应放到八宝山革命烈士公墓；六、陶铸定为叛徒案是不对的，应予平反；
七、杨尚昆被定为阴谋反党、里通外国是不对的，应予平反；八、康生、谢富治民愤很大，对他们进行揭发、批判是合理的；九、一些地方性重大事件，中央决定一律由各省、市、自治区党委根据情况实事求是予以处理。
华国锋显然没有意识大多数与会者的进一步要求，即拨乱反正、端正指导思想。他要求大家按照会议的议程，从11月26日开始，转入讨论经济工作。但是，会议已不可能按照预定议程和华国锋要求进行了。
在接下来发言中，有人开始对开展真理标准问题讨论以来出现的活跃局面表示担心，说这本来是党内存在的思想分歧问题，而不是政治问题、路线问题。现在报刊上提“来一个思想解放运动”、“反对现代迷信”等，势必会导致否定毛泽东、怀疑毛泽东思想。这实际上还是围绕“两个凡是”争论的继续。
胡乔木针对会议上某些看法，说道，这个问题本来是一个理论问题，但在两个意义上也是政治问题。第一，搞清楚这个问题，对于解放思想，搞好当前工作，加速四化建设，正确处理遗留下来的各种案件等，都具有指导意义。第二，对这个问题的讨论，绝大多数省、市和大军区负责人都表了态，这也就不是一般的理论问题了。
胡乔木此番言语，可谓切中要害。
会议在这个问题上的看法越来越趋于一致，多数人明确提出，不解决这个问题，不解放思想，就无法拨乱反正，并纷纷要求中央主要领导予以表态。在这种情况下，一直坚持“两个凡是”的华国锋和汪东兴，不表态显然是不行了。
华国锋作了自我批评，他说，“两个凡是”是过于绝对了，是不妥的。这“在不同程度上束缚了大家的思想，不利于实事求是地落实党的政策，不利于活跃党内的思想。”华表示责任应由他承担。
华的表态无异于宣布，中央已坚决抛弃和否定了“两个凡是”的主张。
会议终于转入华国锋等企盼的关于农业问题的两个文件的讨论。但是，同样出人意料，大多数与会者认为，这两个文件，即《关于加快农业发展速度的决定》和《农村人民公社工作条例(试行草案)》，既没有实事求是地总结建国以来农业战线的经验教训，也没有实事求是地指出当前存在的问题。
胡乔木在发言中指出，多少年来，我们对农业缺少认真的研究，这次会前也缺少足够的准备。因此，对农业上不去的根本原因，怎么才能上去，谁也谈不出系统意见。他建议，这次会上只搞两个关于农业具体问题的决议，即提高农产品收购价格和增加农产品进出口，至于加快农业发展速度的决定，待会后经过认真研究再搞。他还提出一个值得深思的问题：1957年以前，我们搞一次运动，生产就上升一次，而那以后，搞一次运动，生产就被破坏一次。为什么？根本原因在于生产力没有变化，却要不断改变生产关系。
李先念十分赞同胡乔木的意见。但是，他认为关于农业的决定还是要搞出来，而且就由胡乔木主持搞。中央正式确定，由胡乔木主持关于农业问题决定稿的修改。
会议后半期，胡乔木主要任务就是主持修改《关于加快农业发展速度的决定》。他临时召集了个班子，分头起草，然后加以比较，选择其中较好的一个。他一边参加会议，一边修改稿子。会议结束时，稿子也拿出来了，并印发给大家讨论。由于时间仓促，胡乔木建议，这次只是原则通过，待会后进一步修改后，再正式下发。会议接受了这个建议，将这个决定连同《农村人民公社工作条例(试行)》发到各地，经过9个月试行和讨论，于1979年9月十一届四中全会正式通过。
这个决定分析了农业现状，总结了建国以来农业战线的经验教训，作出了农业现代化战略部署。决定提出，可以在生产队统一核算和分配前提下，包工到作业组，联产计酬；粮食统购价从1979年夏粮上市起提高20％，超购部分再加价50％；粮食征购指标在今后一个较长时间内，稳定在1975年的基础上，并减少50亿斤。国家实行低税或免税政策，大力发展社队企业，发展小城镇建设等等。虽然形势的发展很快突破了这些规定，但是作为中央文件，这个决定对于冲破禁区、解放思想、调动亿万农民的积极性和创造性，起到了它应该起到的历史作用。
这次工作会议原先计划开半个月，但实际上却开了36天。会议快要结束了，大家希望邓小平能讲一讲。邓小平在闭幕会上作了永载史册的《解放思想，实事求是，团结一致向前看》的讲话。
会议开始后不久，邓小平就打算讲一次。他找来胡乔木，要他起草一个讲话稿。胡乔木按照邓小平的意思，很快完成了任务。但是，会议期间形势发展很快，出乎了很多人的意料。这样，原先准备的讲话稿就没有用处了。