孔祥熙参加宋家家宴后没几天，宋蔼龄就正式向孙中山提出了辞职。孙中山舍不得失去这样一位好助手，当时沉默了好一会儿才开口。他语调沉缓，高度评价了宋蔼龄几年来的工作，赞扬了她的工作精神、办事能力和负责态度，并对宋蔼龄作了诚恳挽留。孙中山说，如果蔼龄准备结婚，以后可以多留一些时间处理家务，每天只要能来两三个小时帮他处理一下最重要的事务就行。他将非常感激。
当时，宋蔼龄突然发现孙中山好像苍老了许多。辛亥革命给历尽千年黑暗的中国带来一线曙光，结果袁世凯的独裁统治又把国家投入黑暗之中。这对革命者是一段非常困难的时期，人民的失望情绪达到了极点。孙中山自己也同样心情沮丧，“二次革命”失败的打击，自身面临的危险和党内的涣散状况使他心力交瘁。当时他正着手做国民党的改造工作，以使党能够统一意志，坚强有力，承担起倒袁并重建共和的重任。当时，孙中山要求所有党员都要在誓词中写明“服从孙先生”，并加盖指模。这一条遭到党内不少人反对，一些多年的战友几乎为此闹翻。孙中山需要一种依靠，特别是身边一个忠实能干的秘书更必不可少。这时候离开，宋蔼龄心中也有些不忍。一时为孙中山的至诚感染，宋蔼龄几乎要答应留下来了。但她忍住了，沉默了一会儿，她终于决心彻底离开，她向孙中山推荐了妹妹宋庆龄来接替秘书工作。她介绍说，宋庆龄非常崇拜先生，热情高、意志坚定，是一位凡事务求完美的理想主义者，她在各个方面都比自己更强，肯定能干得更好。当时孙中山默默点了点头。
那一天，两人几乎没再说话。宋蔼龄处理了手头紧急的事务，把其他的案卷作了清理，未完的事情都加了说明性的文字，以便为宋庆龄能很快熟悉情况展开工作做了准备。
宋蔼龄那天下午离开的时候，孙中山中断了和党内干部的谈话，他亲自送出门外。握手道别后，他又一直目送她的车子远去。
当樱花烂漫的时节来临，宋蔼龄和孔祥熙以闪电般的速度定下了他们的婚事。孔祥熙拿出两枚银币轻轻撞击，银币发出清脆甜润的声音。这是大吉大利的兆头。那年4月的一天，他们的婚礼如期举行了。
那天早上，火红的太阳从薄薄的云霓中跳出，射出万道金光。宋蔼龄和孔祥熙向冥冥中的上帝发出他们的赞美和感激：“啊，上帝，保佑我们的婚礼，保佑我们一生的幸福！”
宋蔼龄精心打扮，穿了粉红色的缎子上衣，上面绣了一只欢快的小鸟，绿色的裙子上绣着象征富贵的牡丹，乌亮的黑发上面斜插了一枝闪亮的龙凤银钗，一枝鲜艳欲滴的红梅。孔祥熙则是传统的新郎装束--藏青色的长袍马褂，胸前一朵大红花。那天婚礼在横滨山丘上的一座小教堂里举行。婚礼的规模很小，只有宋耀如一家人和特意赶来的孔祥熙的一位堂兄参加，他们尽量使婚礼表现一种温馨的情调。没有通常婚礼惯有的起哄、挑逗、放肆和淫荡的笑声，一切都按部就班，温情脉脉。
教堂的仪式结束后，不料天却下起了大雨。宋蔼龄和孔祥熙站在教堂门口，望着排空而下的雨箭把满树粉红色的樱花打落在地，又被棕淙的雨水冲到道路两侧的阴沟里，一团一团的花球时聚时散。当即宋蔼龄紧抓着孔祥熙的手有些发抖：“花遭雨打水浇，上帝不保佑我了吗？” 孔祥熙朗朗笑道：“中国风俗，结婚下雨是喜。雨越大越是喜。第一、下雨说明娶的媳妇水灵、漂亮；第二么水是财。雨越大，说明日后发财越大……”宋蔼龄回身对母亲说：“妈咪，祥熙说，结婚下雨是喜。”倪桂珍赶忙也说：“是喜是喜！下吧，再下大点。”
过了一会儿，天空又放晴了，阳光从云缝中射下，空气里散发着潮湿的泥土气息，呈现出一派风和日丽的春光景象。新郎、新娘立即乘坐一辆马车，两个人在亲人的护卫下，前往镰仓胜地。
孔祥熙把他的住处已装修得富丽堂皇，新婚洞房的一切都按宋蔼龄的意见装饰布置的，完全是美国式的西方情调。当时偏有人探知孔宋婚恋的经历，加上结婚当天的天气，遂按中国风俗送上了一幅喜联贴到了门媚上。上联是“风调雨顺，乃为天公作美助兴；” 下联是“金玉良缘，原是泰山牵线穿针。”宋蔼龄对下联中牵扯出父亲作煤一事甚感不快，认为它暗含椰榆，要把它撕掉。孔祥熙却感到这不仅是实情，且抬高了自己身价，就哈哈一笑说：“难得这位才思敏捷！结婚大喜，朋友插科打浑，图个热闹。一撕岂不拂了朋友情面，反不愉快。由它去吧。” 宋蔼龄才只好作罢。
当晚两人入了洞房，男欢女爱，开始了蜜月生活。
宋蔼龄摆脱了几年来紧张繁重的工作，一下子换成了一种轻松自在的日子。她尽情地享受着新婚的幸福--孔祥熙的温存和他提供的物质享受。一时优哉游哉，好不惬意。
宋庆龄接任秘书后，她不仅在工作上帮助了孙中山，更在精神上支持了孙中山。她对革命的赤诚炽烈之心，如同一文火炬照亮了孙中山一度黯淡的心情。现在孙中山精神焕发，信心倍增，浑身都流淌着青春般的血液，改造国民党的大业进行得卓有成效。
几个月之后，也就是1914年7月8日，孙中山创立的新党--中华革命党在日本正式成立。当时，孙中山阐述创立新党的考虑是：二次革命所以失败，“非袁氏兵力之强”，“乃同党人心之涣散”，此次创立中华革命党，是为坚定革命信心，重新集结革命力量。当时由孙中山出任党的总理，陈其美、居正、张静江、胡汉民、张继、廖仲恺等人为总务、党务、军务等各部正副部长。中华革命党的纲领是“以实行民权、民生两主义为宗旨”，“以扫除专制政治，建设完全民国为目的”。在组织原则上，明确规定党员“必须以牺牲一己之身命、自由、权利，而图革命之成功为条件。立约宣誓，永远遵守。”“凡党员有背党行为，除处罚本人外，介绍人应负过失之责。”为改变国民党“主持党务者，半为官僚所软化” 和成分复杂的情况，宣告此次建党办法，务必正本清源：第一、据斥官僚；第二、淘汰假革命党。以防止第一次革命时形形色色的不同动机、不同面目的人纷纷投机混入党内，结果鱼龙混杂，以伪乱真，异党入据，大权旁落，真正革命党反遭排斥，革命也完全变味的情况。