一九六五年，海峡两岸的形势，仍如绷紧了的弦。
元旦刚过，一月二日，一架美军无人驾驶高空侦察机便在中国东南地区上空被击落；
一月十日，蒋军一架美制“U2”型高空侦察机在中国华北地区上空被击落；
三月十八日，蒋军一架美制“RF101”型飞机在中国东南沿海上空被击落；
三月三十一日，美军一架无人驾驶高空侦察机在中国华南地区上空被击落；
四月三日、十八日，两架美军无人驾驶高空侦察机在中国中南地区上空被击落；
五月二日，中国人民解放军击沉蒋军“东江”号巡逻舰，近百名国民党士兵葬身大海；
八月六日，激烈的海战又起。在福建南部诏安海湾，两艘国民党军舰运载一批特种部队准备登陆，遭到中国人民解放军猛烈反击。两舰名叫“漳州”号、“剑门”号，均沉没海底，死伤达数百人。尤其是“剑门”号，排水量为八百九十吨。这次两舰覆没，台湾为之震惊……就在两次海战之间，七月十四日，香港《快报》刊出独家新闻，使台湾一片哗然:“李宗仁将返大陆！”翌日，美联社自日内瓦发出电讯称:“香港报章推测中国前总统李宗仁可能前往北京，此间台湾官员对此表示怀疑。”就在“台湾官员对此表示怀疑”之际，七月十八日上午十一时，李宗仁和夫人郭德洁出现在上海虹桥机场，受到早已在那里等候的周恩来、陈毅、叶剑英的热烈欢迎。
七月二十日，当李宗仁夫妇飞往北京，周恩来提前二十分钟到达，又在北京机场迎接他们的到来。
七月二十六日，毛泽东在中南海宴请李宗仁夫妇，表示热忱的欢迎。
毛泽东一见李宗仁，出语惊人:“德邻先生，你这一次归国，是误上贼船了！”
李宗仁一听，一时不知如何答复。
毛泽东哈哈大笑:“蒋介石口口声声叫我为‘匪’，还把中国大陆称为‘匪区’。你今天到‘匪区’来见‘匪’，岂不是误上贼船！”听毛泽东这么一说，李宗仁也不由得哈哈大笑起来……李宗仁回归北京，其实是意料中的事。李宗仁与蒋介石的深刻矛盾，使他理所当然倒向北京。
早在一九五○年七月，李宗仁便向美国共和党领袖罗伯特·塔夫脱谈及国民党失败的原因时，尖锐地抨击了蒋介石:“就我所知，国民党所以失败，实由于蒋介石二十年的独裁专制，政治腐败，人心离散；军事上指挥错误，士无斗志。这些是主要因素。”
在一九五八年至一九六二年由李宗仁口授、唐德刚笔录的《李宗仁回忆录》中，他便这样论及毛泽东和蒋介石:中共席卷大陆以来，政权已渐稳定。唯中共急于工业化和实现共产社会理想，不无躁进之嫌。然中共十余年来百废俱兴，建设规模之大与成就之速，皆史无前例。国势日振，真可说举世侧目。我本人虽失败去国，而对北平诸领袖的日夜孜孜，终有今日，私心弥觉可喜。
至于台湾，十余年来，蒋小朝廷内的一切作风似仍沿袭大陆时代的恶习而无甚改进，且有甚于大陆时代。如此而犹欺人自欺，动辄以“反攻大陆”作宣传，岂不可笑。一种政治宣传，如果连自己都欺骗不了，又如何能欺骗世人呢！
李宗仁还回忆起他跟毛泽东最初的交往:
我和毛泽东第一次见面，是在国民党二中全会的会议席上。他那时任国民党中央党部所办的农民讲习所所长，并担任短时期的国民党中央宣传部代理部长。他身材高大，时常穿一件蓝布大褂。在会议席上，他虽发言不多，但每逢发言，总是斩钉截铁、有条不紊，给我印象很深，觉得这位共产党很不平凡。
一九六三年七月十四日，意大利米兰《欧洲周报》发表李宗仁对该报女记者奥古斯托·玛赛丽的谈话。他这么谈及蒋介石:
许多年来，蒋一直是中国元首，而现在他的举动好像他的经验还没有一个村长多，他不懂历史。每年一度他站在金门、马祖海边的悬崖上发表演说。他总是重复着同样一句话:“我们一定要回去。”很难说他本人是否了解这一事实，回大陆是不可能的。
李宗仁接着又谈到了他自己:
我像蒋介石和国民党一样，是一个失败者。唯一的区别是，我完全不把这件事放在心上。作为个人来说，我自己无关紧要，我不能妨碍中国的前途和她的进步。我由于自己的失败而感到高兴，因为从我的错误中一个新中国正在诞生……什么时候我们曾经有过像我们今天有的这样一个强大的中国呢？
经过李宗仁的政治秘书程思远幕后穿梭，多次密访北京，由周恩来作了安排，这样一九六五年六月十三日，李宗仁以陪夫人前往瑞士治病的名义，飞往苏黎世小住。然后悄然前往巴基斯坦卡拉奇，由那里转往广州……
李宗仁的归来，在中国大陆刮起一阵“李宗仁旋风”。中共各方要人、国民党各地旧部，纷纷宴请李宗仁夫妇。内中最为有趣的是，末代皇帝溥仪握着他的手说:“欢迎你回到我们伟大祖国怀抱里来！”末代皇帝和末代总统的相见，一时传为佳话。
李宗仁于一九六九年一月一日，死于直肠癌，终年七十八岁。