英国的领兵将官伯麦，既到了定海，遂令领事义律，率着八艘军舰，向天津进发。到了天津海口，京师颇为震动。道光帝日夜忧虑，常召军机大臣穆彰阿入内议事。这穆彰阿平时与林则徐等本不相和协，至是遂奏林则徐办理不善，轻开战衅，宜一面惩办林则徐，一面再定和战事宜。道光帝尚在未决，忽然直隶总督琦善递上封奏一本，内称"英国兵舰驶至天津海口，意欲求抚我朝，不如俯顺外情，罢兵息事为是。且粤督林则徐，办理禁烟，亦太操切。伏乞皇上恩威并济，执两用中"等语。道光帝览了奏牍，又去召穆彰阿商量。穆彰阿与琦善本是臭味相投的朋友，穆彰阿要害林则徐，琦善自然竭力帮忙，况且这班奸臣，屈害忠良，是第一能手，欲要他去抵御外人，他却很是怕死，一些儿没能耐。这时，义律到津，直至总督衙门求见。琦善闻英领事来署，当即迎入。义律取出英议会致中国宰相书，交与琦善。琦善本由大学士出督直隶，展开细瞧，半字不识。随令通事译读。首数句无非说东粤烧烟，起自林、邓二人，春间索偿，被他诟逐，所以越境入浙，由浙到津。琦善听了，尚不在意，后来通事又译出要约六条。那六条是：第一条，赔偿货价；第二条，开放广州、福建、厦门、定海、上海为商埠；第三条，两国交际，用平等礼；第四条，索赔兵费；第五条，不得以英船夹带鸦片，累及居留英商；第六条，尽裁洋商（经手华商）浮费。琦善听毕，沉吟了好一会，琦善在大沽口与英人谈判旧照方向义律道："汝国既有意修和，那时总可商议。明日请贵兵官来署宴叙便了。"义律别去。次日，琦善今厨役备好筵宴，专待客到。约至巳牌时候，英国水师将弁二十余人，统是直挺挺、雄赳赳地走入署中。
琦善接入，见他们威武非凡，不由得心头乱跳。英兵官虽不能直接与他谈论，然已瞧透他畏惧神情。便箕踞上坐，命随来的通事，说本国已发大兵若干人，炮船若干艘，即日可到中国，若中国不允要求，请毋后悔。这番言语吓得琦善面色如土，忙央通事说情，愿为转奏。英将弁眉飞色舞，乐得大嚼一顿。席散后，琦善便据实奏陈，当由穆彰阿一力推荐，道光帝便命琦善赴粤查办。琦善闻命，即与英领事义律约定赴粤议款。义律等徐返舟山。琦善入京听训，造膝密陈，廷臣多未及闻知。迨琦善出京，部中接山东巡抚讬浑布奏报，略称义律等自津回南，路过山东，接见时很是恭顺。今因琦中堂赴粤招抚，彼亦返粤听命云云。又接到伊里布奏本，据说与英人订休战约，愿还我定海等语。部臣方识琦善、伊里布统是一班和事老，有几个见识稍高，已料到后来危局，然内有穆彰阿，外有琦善、伊里布，内外朋比，说亦无益，还是得过且过，做个仗马寒蝉。
林则徐方加意海防，严缉私贩，每月获到贩烟人犯，总有数起，则徐一一奏闻。起初接廷寄，多是奖勉的话头，一日，传到京抄，上载"大学士琦善奉旨赴粤查办"，林则徐不觉惊疑。正想具折奏问，忽京里发下圣谕，则徐跪接拆开，见上面说道："外而断绝通商，并未断绝；内而查拿犯法，亦不听净尽，无非空言搪塞，不但终无实济，反生出许多波澜。思之曷胜愤懑，看汝又以何词对朕也？特谕。"则徐览毕无语。幕友在旁瞧着，不禁气愤，随道："大帅这般尽力，反得这般批评，令人不解。"则徐叹道："信而见疑，忠而被谤，古今来多出一辙。林某自恨不能去邪，所以遭此疑谤。现既奉谕申斥，不得不自去请罪。"随即拟请罪折子，并加附片，愿戴罪赴浙，投营效力。当下交给幕友誊清，即日拜发。甫发奏折，又来严旨一道：
前因鸦片烟流毒海内，特派林则徐驰往广东海口，会同邓廷桢查办，原期肃清内地，断绝来源，随地随时，妥为办理。为自查办以来，内而奸民犯法，不能净尽，外而私贩来源，并未断绝。本年福建、浙江、江苏、山东、直隶盛京等省，纷纷徵调，糜饷劳师，此皆林则徐办理不善之所致。林则徐、邓廷桢着交部分别严加议处，两广总督着琦善署理，未到任以前，着怡良暂行护理。钦此。