皇帝又命宋庆总管各路人马，统制各军。但各路统领与宋庆资格，多是不相上下，忽接朝廷旨意，要归他节制，免不得郁郁寡欢。宋庆到了九连城，收集平壤败兵，倚城下寨。九连城濒鸭绿江口，为辽东第一重门户，这重门户不破，辽东自可无恙。宋庆把守此处，也算是因地设险。当下传集各统将，分守汛地，叫他们努力防御。各统将虽是面从，心中很是不悦，出了大营，满肚里都受着委屈，他也不愿尽力，我也不肯效命，勉强起程，按着所派汛地，率军进行。
那边的日本兵确是勇猛迅速，闻鸭绿江西岸清军未曾严守，当即率兵飞渡过鸭绿江，浩浩荡荡杀奔九连城。这时刘盛休、依克唐阿、马玉昆、丰伸阿、聂士成诸将，沿途抵敌，都杀不过日本兵。清军退一里，日兵进一里；清兵退十里，日兵进十里；待日军进薄到九连城，各路兵将统已逃去。那日兵如风驰电掣一般，接连陷了金州、大连湾，并用计将旅顺口总办龚照屿吓走，日兵不费一弹，将旅顺海口得了。这时候。日本兵舰已纵横江海，视北面的盖平、营口已在囊中，南面的荣城、登州又仿佛握在掌内。丁汝昌旧照狼狈不堪的丁汝昌，方困守威海卫外的刘公岛，只望日兵饶恕了他不来作对，谁知日兵偏不许他独生，开着大舰，架起巨炮，又向刘公岛进攻。可怜汝昌手下，只有几片败鳞残甲，一阵轰击，定远、威远、来远三艘又被打沉，丁汝昌亦受了弹伤。刘公岛势处孤危，万不能守，日兵还是接连开炮。四围攻打。汝昌到此，垂头丧气，饬兵士竖起白旗，一面致书日将，约不得伤害地方民命，自己哭了三四次，仰药自尽。日兵遂据刘公岛，并入威海卫。于是北洋第二个军港亦被日本夺去，所有败残军舰，统归日兵占领。清廷还起用恭亲王奕总理海军事务，其实辽海沿岸，大小兵轮只有旭日旗招飐，并没有龙旗片影，还要管理什么海军？
光绪帝迭闻败报，召王大臣会议。从前锐意主战、慷慨激昂的诸人物，至此都俯首无言。独有二个满员，上书言事，煞是可笑：一个满御史，请起用檀道济为大将。檀道济是刘宋时人，死了一二千年，为什么奏请起用？他因同僚拟用董福祥，假名檀道济以示意，他即问檀道济三字，如何写法？经同僚书示，遂冒昧照奏；又有一个满京堂，奏称日本东北有两个大国，一是缅甸，一是交趾，日本畏他如虎，请遣使约他夹攻，必可得志。光绪帝见了这等奏章，又气又恨，只得与恭王等商议，定了一个议和的计策，命侍郎张荫桓、邵友濂赴日本议和。日本很是厉害，拒绝两使，他说这等小官，不配讲和。弄得张、邵二人，垂头丧气，踉跄归来。不得已，又派李鸿章为全权大臣，速赴日本议和。恭王即饬军机处办事人员，电达天津。李鸿章接着此旨，明知战败求和，还有什么光彩？但事已如此，欲救眉急，不得不硬着头皮，指日前往。方就道时，先电商各国驻华公使，请为臂助。俄使喀希尼，慨然答复，愿保全中国疆土，代拒日本。李鸿章始航行而东，到日本山阳道海口，地名马关，日本已遣专使伊藤博文及陆奥宗光，在马关守候。鸿章在途中，屡接中国警耗，日兵北据营口，南占澎湖，心中正焦灼，见了伊藤、陆奥两人，寒暄已毕，便请停战。伊藤、陆奥不允，必欲先订和约，方许停战。
经鸿章再三磋商，才提出停战条件。他条件是什么？他说要山海关、大沽口及天津三处作抵押品。这三处乃是京畿要口，押与日本，简直是引狼入室，叫这位李钦差如何答应？没奈何把停战问题，暂时搁起，先把和款商量起来。伊藤、陆奥煞是厉害，要索各款，统是不堪忍受。鸿章与他辩论，他却绝不理会，反将冷语谐词，李鸿章晚年旧照调侃鸿章。鸿章此时，既不敢反唇相讥，又不便屈意情就，只得煞了一肚子气闷，拿出迁延手段，敷衍他们。今朝说明朝再议，明朝说后日再议。一日，自会所返寓，鸿章因连日会议，毫无效果，坐在马车中，正自忐忑不安，突听得枪声一发，忙从左边一顾，不防劈面来了一颗弹子，正中左颧。鸿章忍着痛，急呼日本警察。日警过来，见鸿章颧血直喷，忙去捉拿刺客。鸿章也不及问刺客情状，匆匆回寓，病了好几日。警闻直达欧美，各国新闻报纸争说日人无理，大有攘臂直前，代鸣不平的意见。日本始自知理屈，遣使谢罪，并饬日医替他调治。伊藤、陆奥亦至李寓道歉，随允转圜和议。鸿章即要约停战，伊藤、陆奥亦即照允。嗣后申定和议，伊藤、陆奥终究不肯多让。李鸿章无可如何，勉依条约十一款，大纲如下：
一认朝鲜为自主国；
二偿日本兵费二百兆两；
三割辽东半岛及台湾、澎湖；
四开沙市、重庆、苏州、杭州为商埠，
五中日旧订之约章，一律废止。嗣后日货进口，运往内地，得暂行租栈，免纳税钞，并于通商各口，得自由制造。