贞观十七年（６４３年）四月丙戌日，太宗亲临承天门，颁诏立晋王李治为皇太子，大赦天下，赐酺三日。自此，太宗终于确立了接班人，心中的一块石头也落了地。
太宗立志要把新太子培养好，己丑日，他亲自指定一批元老重臣，组成了一个阵营强大的东宫辅佐班子，诏以长孙无忌为太子太师，房玄龄为太子太傅，萧瑀为太子太保，李祐为太子詹事，左卫大将军李大亮领右卫率，前詹事于于志宁、中书侍郎马周为左庶子，吏部侍郎苏勗、中书舍人高季辅为右庶子，刑部侍郎张行成为少詹事，谏议大夫褚遂良为宾舍。
不依规矩不能成方圆，太宗又命礼部，为太子定了见三师的礼仪：三师来，太子迎三师于殿外，太子先拜，三师答拜。太子进门时，让三师先行。三师坐，太子乃坐。太子与三师书，前后皆称“治惶恐”。
定好编制及礼仪后，太宗驾至东宫，排开盛宴，招待东宫的僚属们。东宫里红毡铺地，两廊奏乐，美酒佳肴，其乐融融。新太子李治亲手为太宗调酒，为三师把酒，动静举止，甚有礼貌，太宗心里甚是高兴，对侍臣们说：
“我若立李泰，那便是太子之位可以经营而得。从今以后太子失道，藩王窥伺的，二人皆不用，这个规矩要传给子孙，永为后法。”侍臣们听了，纷纷点头赞成。
席间又谈到功臣子弟的朋党之争，太宗因问大家：
“自古草创之主，至于子孙多乱，何也？”
房玄龄接口道：“此为幼主生长深宫，少居富贵，未尝识人间情伪，治国安危，所以为政多乱。”
太宗见房玄龄一意说“幼主”不好，心里烦气。房玄龄之子房遗爱参与李泰党羽活动，太宗心里早就不满，当即反驳房玄龄道：“公意推过于主，朕则归咎于臣。昔隋炀帝录宇文述在藩之功，擢化及于高位，不思报效，反行弑逆，此非臣下之过欤？”房玄龄谓后世君主不肖，也是随着太宗的话茬而答的，没想到太宗话题一转，把责任归咎于臣下。房玄龄马上意识到太宗所为何因，忙离座叩首道：“陛下教训极是。”
太宗又道：
“朕发此言，欲公等诫勖子弟，使无愆过，即国家之幸也。从今之后，诸公不但要辅佐好太子，使之成为治世之良主，而且要教育好自家的子弟，使其成为治世之良臣。”
侍臣们听了，急忙拱手应承。太宗环视左右，把目光停在李祐身上，其他人如长孙无忌等不用再嘱咐也会尽心辅佐太子，独有这个李祐，太宗常常摸不着他的心思，于是从容对李祐说：
“朕求群臣可托幼孤者，无以逾公，公过去不负李密，想现在也不会负朕！”
李祐听出太宗话里有因，忙伏地叩头，啮指出血，流涕辞谢道：
“臣尝得暴疾，陛下自剪龙须，和之为药，以救臣命。臣累受陛下之洪恩，敢不肝脑涂地，以报万一！”
太宗见李祐说着说着哭了，忙令人把他扶回座位上，赐以御酒，李祐连饮数杯，不觉沉醉，伏在坐榻上不能起来。太宗心里暗暗点了点头，脱下身上的龙袍，对李治说：“给李爱卿盖上，别着凉了。”
李治忙过去接过御服，轻轻盖在李祐身上，太宗此举，引来侍臣们一片唏嘘之声，侍臣们交头接耳地称赞了一番。
太宗对新选的宝贝太子，可不敢再松懈了。让他常侍宫闱，以便随时教诲。在教育方法上，太宗一改过去只传授经义的抽象教学法，采取“遇物必有教谕”的生动教学法。吃饭的时候，太宗常常停下来，手拿着筷子，指着满桌子热气腾腾的美味佳肴，考问太子。
“怎样才能经常吃到这么好的御膳？”
太子李治嘴里边嚼着好吃的东西，边老老实实地答道：“不知道。”
太宗随即教育道：
“你要知稼穑之艰难，抚民以静，爱民如子，使农不劝而耕者众，但得人民富足，国库充盈，则长有斯饭矣！”
李治听了，自然频频点头称是。饭后，太宗又怕太子积食，又带他到太液池逛逛。肚子撑得饱饱的李治，费力地爬上马背，刚打马要走，太宗又止住地问：“如何才能常有马骑？”李治摇了摇头：“不知道。”
“你要知其劳逸，不竭其力，则常得乘之矣！”
李治听得似懂非懂，心说马累了，再换一匹马不就得了。太宗见他不晓事的样子，继续阐述道：
“骑马有如驭民，只有少用民力，给民以休养生息的机会，这样才能保持你长久的统治。”
这下李治听懂了，急忙点头表示明白。来到太液池，父子俩弃马上船，龙船荡荡，碧水悠悠，太宗又不失时机地教导李治道：“水可载舟，亦可覆舟。君犹舟也，民犹水也”。
船到对岸，父子俩来到一棵银杏树下歇息，太宗问李治：“你知道为什么四夷都称我为‘天可汗’，百姓群臣都称我为‘明主’吗？”
“那是因为他们都怕父皇。”李治说完又觉不妥，忙又改口道，“那是因为父皇本事大！”
太宗呵呵一笑，站起身来，用手拍拍那棵笔直的银杏树说：“木从绳则直，人从谏则圣。一个人的能力毕竟有限，只有虚心纳谏，才能谨慎施政，方至功业兴隆。”
太子李治常侍宫闱，经常与父王同起同坐，固然学了不少东西，但无疑问又疏远了东宫僚属，黄门侍郎刘洎及时上书道：